병의원 전문세무사
이룡권
병의원 기장/세금신고 상담에서는 공단 청구/지급액과 본인부담금, 비급여 수납을 맞춥니다. 진료 구분표와 결제 원본, 시설/장비 및 인력 지급자료로 수입과 지출을 대조합니다.
결론부터 병의원 세금은 청구/수납, 진료 구분, 인력/동업 이 세 가지를 맞춰 보는 데서 갈립니다. 상담에서는 먼저 요양급여 청구, 심사, 지급 집계와 본인부담금, 비급여 수납을 대조해 삭감과 지급 시차를 확인합니다.
병의원에서 많이 묻는 질문
결론부터 정리한 세금 Q&A입니다.

상담에서 먼저 확인합니다.
- 청구/수납
요양급여 청구/심사/지급 집계와 본인부담금/비급여 수납을 대조해 삭감과 지급 시차를 확인합니다.
- 진료 구분
급여/비급여/과세 시술 구분표와 결제 집계를 맞추고 장비/시설의 공통 사용을 확인합니다.
- 인력/동업
급여/원천징수 내역과 동업계약/분배비율을 대조해 공동경비와 원장별 개인지출을 구분합니다.
진료 유형을 눌러 하나씩 볼 수 있어요.
1, 보험 진료 중심 의원
공단에서 받는 돈도
수입금액입니다.

진료비 1,000만원은 두 곳에서 들어옵니다
보험 진료만 있다고 가정한 단순 예시입니다. 비급여 항목은 진료 성격을 따로 봅니다.
통장 입금액만 보면 공단 지급분 시차나 차감액 때문에 수입금액과 다를 수 있습니다.
먼저 맞춰볼 자료, 세 묶음
| 자료 | 맞춰볼 것 | 주의 |
|---|---|---|
| 요양급여 청구/지급 내역 | 청구액/지급액/삭감 | 지급 시점과 진료 시점 차이 |
| 카드/현금영수증/현금 | 본인부담금/비급여 | 현금 수납분 누락 없이 |
| 진료과목별 매출표 | 급여/비급여/과세 시술 | 면세/과세 구분 근거 |
병원 사업장현황신고는 언제 하나요?
면세 수입은 다음 해 2월 10일까지 사업장 현황신고를 합니다. 과세 시술이 있어 부가세 신고를 하면서 면세 수입금액을 함께 신고했다면 그 면세분은 사업장 현황신고를 한 것으로 봅니다. 의료업은 신고하지 않거나 수입금액을 적게 신고하면 그 금액의 0.5% 가산세 대상입니다.
가산세 대상은 의료업/수의업/약국으로 한정되어 있어 병의원은 특히 신고 수입금액을 꼼꼼히 맞춥니다. 면세 수입금액에는 공단 지급분과 환자 본인부담금, 비급여 면세 진료가 함께 들어갑니다.
현금으로 받은 진료비도 현금영수증을 끊어야 하나요?
병원/의원/치과의원/한의원은 현금영수증 의무발행업종입니다. 건당 10만원 이상을 현금으로 받으면 손님이 요청하지 않아도 발급합니다.
미발급 가산세는 미발급금액의 20%이고 10일 이내 자진 신고/발급하면 10%입니다. 국민건강보험 급여 대상인 경우 등 시행령이 정한 경우는 가산세에서 제외됩니다.
2, 미용/성형 진료
같은 병원 안에서도
과세 매출이 생깁니다.

과세 시술 1,100만원을 받았다면
과세 시술 대가에 부가세가 포함되어 있다고 가정한 예시입니다.
매출세액 100만원이 곧 납부세액은 아닙니다.
공통 매입세액은 면세/과세 비율로 나눠 계산합니다.
과세로 보는 진료, 시행령 기준
| 구분 | 예시 | 확인 |
|---|---|---|
| 성형수술 | 쌍꺼풀/코성형/유방확대/지방흡인/주름살제거/안면윤곽/치아미백/라미네이트 | 후유증 치료/재건수술 등은 제외 |
| 피부/미용 시술 | 기미/여드름 치료, 제모, 탈모치료, 모발이식, 문신제거, 피부미백, 항노화, 모공축소 | 시행령 열거 여부 확인 |
| 그 외 진료 | 질병 치료 목적 진료/검사 | 면세 의료보건 용역 |
병원도 부가세를 내나요? 미용시술은요?
질병 치료 목적의 의료보건 용역은 부가세 면세입니다. 다만 쌍꺼풀/코성형/지방흡인 같은 성형수술과 여드름/기미 치료, 제모, 탈모치료, 피부미백 등 시행령에 열거된 진료용역은 요양급여 대상에서 제외되는 경우 과세입니다. 면세 진료와 과세 시술을 함께 하면 매출을 나눠 신고합니다.
과세 시술이 있으면 부가세 신고와 세금계산서/영수증 발급 의무가 따릅니다. 장비/인테리어처럼 면세 진료와 과세 시술에 함께 쓰는 매입은 공통매입세액 안분을 검토합니다.
진료 목적 판단은 차트와 시술 내용 같은 실제 자료로 합니다. 메뉴판 명칭만으로 정하지 않습니다.
부가세 신고 때 현금매출명세서도 내나요?
보건업은 부가세 예정/확정신고 때 현금매출명세서를 함께 제출하는 업종입니다. 제출하지 않거나 사실과 다르게 적으면 해당 수입금액 또는 차액의 1%가 가산세입니다.
3, 공동개원/명의 확인
명의보다
실제 운영자를 봅니다.

누가 실제로 수익을 가져가나요?
귀속이 명의일 뿐이면 실제 귀속자를 납세의무자로 봅니다.
공동개원이면 이 세 가지를 맞춰두세요
| 확인 | 자료 | 핵심 |
|---|---|---|
| 손익분배 | 동업계약서/분배비율 | 등록 내용과 실제 분배 일치 |
| 출자/차입 | 출자금/대출 약정 | 이자 비용 인정 여부 별도 검토 |
| 개별 지출 | 원장별 경비 증빙 | 공동경비와 개인지출 구분 |
원장이 아닌 사람이 병원을 운영하면 어떻게 되나요?
명의상 원장과 실제 운영자가 다르면 세법은 소득이 사실상 귀속되는 사람을 기준으로 봅니다. 면세 신고 내용, 명의 사업자등록 가산세, 부과 기간 등은 실제 사실관계에 따라 따로 검토합니다. 의료법상 개설 문제도 별도로 생길 수 있습니다.
다른 사람 명의로 사업자등록을 하거나 그 등록을 이용해 사업하면 부가가치세법상 공급가액의 2% 가산세 규정이 있습니다. 실제 적용은 사실관계 확인이 먼저입니다.
이 페이지는 의료법상 개설 자격 판단을 다루지 않습니다. 운영 구조가 의심되면 법률 검토를 함께 받으시길 권합니다.
모든 유형 공통
매출이 커질 때,
감면 받을 때 확인할 것
해당 연도 수입금액 5억원
이익 대신 수입금액 기준입니다.
여러 업종/사업장은 환산 규정을 함께 봅니다.
병의원도 세액감면을 받나요?
의료기관 운영 사업은 중소기업 특별세액감면 대상 업종입니다. 의원/치과의원/한의원은 해당 과세연도 수입금액 중 요양급여비용 비율이 80% 이상이고 종합소득금액이 1억원 이하인 경우로 한정합니다. 소기업 감면율은 10%, 수도권 외 중기업은 5%이며 한도는 기본 1억원입니다.
감면은 소득세/법인세에 대한 것이고 2028년 12월 31일 이전에 끝나는 과세연도까지 적용됩니다. 상시근로자가 줄면 한도가 줄어듭니다. 소기업 여부, 수도권 여부, 다른 감면/공제와의 중복 제한을 함께 확인합니다.
| 구분 | 감면율 | 조건 |
|---|---|---|
| 소기업 | 10% | 지역 무관 |
| 중기업 | 5% | 수도권 외 사업장 |
| 의원/치과의원/한의원 | 위 비율 | 요양급여 80% 이상 + 종합소득금액 1억원 이하 |
근거: 조세특례제한법 제7조
의원도 간이과세자가 될 수 있나요?
의사업/한의사업은 간이과세 배제 업종입니다. 과세 시술 매출이 있다면 일반과세자로 부가세를 신고합니다.
성실신고 기준은 보건업 5억원으로 확인했습니다. 병원급/법인 형태라면 적용 규정이 달라질 수 있습니다.
보내주실 자료는
다섯 묶음이면 됩니다.
개설/등록/진료과/개원일
공단 청구/카드/현금 수납
급여/비급여/과세 시술
계약/세금계산서/리스
급여/원천징수/동업 분배
없는 자료는 빠진 항목으로 표시하세요. 임의로 채우지 않습니다.
규모에 따라 맡기는 범위가 다릅니다
필요한 만큼만 맡기시면 됩니다. 보수는 업무 범위를 확인한 뒤 안내하고 기장료 안내에서 미리 가늠해 보실 수 있습니다.
- 혼자 운영하는 작은 사업장신고만 맡기셔도 됩니다. 병원 정보, 수입 원본 자료부터 준비해 주세요.
- 직원이 있거나 매출이 커진 경우매달 장부와 인건비 신고까지 맡기시는 쪽이 안전합니다. 진료 구분 부분을 달마다 맞춰 둡니다.
- 사업장이 둘 이상이거나 법인인 경우장부에 분기마다 손익 점검을 더합니다. 성실신고 기준이나 법인 전환 시점을 미리 계산해 봅니다.
병의원 1분 자가 점검
아래 질문에 바로 답할 수 있는지 보세요. 답은 이 페이지 아래에 있습니다.
- 병원 사업장현황신고는 언제 하나요?
- 현금으로 받은 진료비도 현금영수증을 끊어야 하나요?
- 병원도 부가세를 내나요? 미용시술은요?
- 부가세 신고 때 현금매출명세서도 내나요?
- 원장이 아닌 사람이 병원을 운영하면 어떻게 되나요?
바로 답하기 어려운 질문이 두 개 이상이면 다음 신고 전에 장부를 한 번 맞춰 보시는 게 좋습니다. 상담 신청
숫자로 보기
병의원은 수입 5억원부터
성실신고확인 대상입니다.
| 업종 | 해당 과세기간 수입금액 | 병의원 해당 |
|---|---|---|
| 도소매업, 부동산매매업 등 | 15억원 이상 | |
| 제조업, 음식점업, 건설업 등 | 7억5천만원 이상 | |
| 보건업, 전문서비스업, 교육서비스업 등 | 5억원 이상 | 병의원, 한의원, 치과 |
대상이 되면 종합소득세 신고가 6월 30일까지로 늘어나는 대신 세무사의 확인서를 함께 내야 합니다. 공단 청구 수입과 비급여 수입을 모두 합쳐 판단합니다.
근거: 소득세법시행령 제133조, 소득세법 제70조의2
1년 일정
병의원의
1년 세금 달력
| 시기 | 할 일 | 근거 |
|---|---|---|
| 매월 10일 | 직원, 강사, 외주 인력에게 준 돈의 원천세 신고(지급한 달이 있을 때) | 소득세법 제128조 |
| 2월 10일 | 사업장현황신고(1년 수입금액 신고) | 소득세법 제78조 |
| 5월 31일 | 종합소득세 신고(성실신고확인 대상은 6월 30일) | 소득세법 제70조, 제70조의2 |
| 11월 30일 | 종합소득세 중간예납(고지서를 받은 경우) | 소득세법 제65조 |
부가세 신고 대신 2월 사업장현황신고를 합니다. 과세 매출이 함께 있으면 부가세 신고도 같이 해야 합니다. 미용 목적 시술처럼 과세되는 진료가 있으면 부가세 신고도 같이 합니다.
병원 세무사 상담,
자주 묻는 질문
병의원 전문 세무사를 찾을 때 어떤 자료부터 준비하나요?
개설/등록/진료과/개원 정보와 공단 청구/지급 집계, 카드/현금 수납 및 진료 구분표를 준비합니다. 장비/리스 계약과 급여/동업 분배자료도 확인합니다. 첫 문의에 환자 이름이나 상세 건강정보는 보내지 않습니다.
피부과 전문 세무사를 찾을 때 과세 시술 자료는 어떻게 준비하나요?
급여/비급여/과세 시술 구분표와 항목별 수납 집계, 카드/현금영수증 원본을 준비합니다. 시술 내용에 따른 구분과 장비/인테리어의 공통 사용을 확인합니다. 첫 문의는 환자 이름/상세 건강정보 없이 집계자료로 진행합니다.
병원 세무는 누가 상담하며 보수는 어떻게 안내받나요?
세무법인 서진 이룡권 세무사가 처음 상담부터 직접 확인합니다. 업종, 거래 방식과 현재 자료를 알려주시면 필요한 업무 범위를 확인하고 보수를 안내합니다. 첫 문의에는 주민등록번호, 계정 비밀번호나 전체 계좌번호를 보내지 마세요.
병원 세무사를 찾거나 추천받을 때 무엇부터 확인하나요?
기장과 세금신고 중 맡길 업무 범위를 먼저 정하세요. 청구/수납/진료 구분/인력/동업 자료를 어떻게 확인하는지, 누가 직접 상담하는지 확인하고 보수와 추가 신고 비용, 자료 전달 방식을 함께 안내받는 것이 좋습니다.
상세 자료는 필요한 범위를 확인한 뒤 안전한 방법으로 전달해 주세요.
여의도 방문 상담, 서울 밖은 비대면
병의원 사장님 기장/신고는 여의도 사무실(9호선 국회의사당역 도보 2분, 서울 영등포구 국회대로 750 금산빌딩 501호)에서 방문 상담합니다. 서울 밖 사업장은 카톡/전화/메일로 자료를 받아 비대면으로 진행하고 사업장 관할 세무서가 어디든 홈택스 세무대리 수임으로 신고까지 맡습니다.
병의원 세무사/병원 세무사/의원 세무사 상담
병의원 기장과 세금 신고 자료를 이룡권 세무사가 처음 상담부터 직접 확인합니다. 지방 사업자도 비대면으로 상담할 수 있습니다.
병의원 세금, 자주 묻는 질문
결론부터 정리한 세금 Q&A입니다.