세금 Q&A, 사업자 세무 일정
상품권 매매와 판매대행을 같이 하는데 임차료 부가세 같은 공통 매입세액은 어디까지 공제받나요?
확인 기준 2026.11.4, 작성/감수 이룡권 세무사
결론부터 매매에만 쓴 매입세액은 공제되지 않고 판매대행에만 쓴 매입세액은 공제됩니다. 사무실 임차료나 관리비처럼 둘에 같이 쓴 공통 매입세액은 총공급가액 대비 면세사업등 공급가액의 비율로 나눠서 계산합니다. 매매 쪽 금액을 크게 잡을수록 공제 가능한 몫은 줄어드니 어떤 금액을 기준으로 넣을지 신고 전에 정해야 합니다.
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한눈에 보기
| 항목 | 내용 (2026-11-04 기준) |
|---|---|
| 매매에만 쓴 매입세액 | 공제 안 됨(국세청 부가가치세과-2066) |
| 판매대행에만 쓴 매입세액 | 공제됨(같은 해석) |
| 둘에 같이 쓴 매입세액 | 공급가액 비율로 안분(부가가치세법 제40조, 시행령 제81조 제1항) |
| 예외 1 | 면세공급가액이 총공급가액의 5% 미만이면 전액 공제, 단 공통매입세액 5백만원 이상은 제외(시행령 제81조 제2항 제1호) |
| 예외 2 | 해당 과세기간 공통매입세액이 5만원 미만이면 공제(제2호) |
| 예정신고 때 | 예정신고기간 비율로 안분, 확정신고 때 정산 |
귀속이 분명한 것부터 나눕니다
국세청은 상품권매매업과 판매대행업을 겸영하는 사업자가 과세되는 재화나 용역을 공급받고 세금계산서를 받은 경우, 판매대행업과 관련된 매입세액은 공제되고 상품권매매업과 관련된 매입세액은 공제되지 않는다고 회신했습니다(부가가치세과-2066, 2008.7.17). 매매 쪽은 부가세 과세 매출로 다루지 않는 것이 실무라서 그 매입세액은 대응할 매출세액이 없다는 취지입니다. 그래서 먼저 매입 항목마다 어느 사업에 쓴 것인지 실지귀속을 가립니다. 대행 전용 모바일 서버비라면 공제, 매매 전용 금고 보관료라면 불공제처럼 나눕니다.
구분이 안 되는 공통 비용은 비율로 나눕니다
사무실 임차료, 공통 직원 급여에 붙는 부가세, 사무용품은 어느 사업에 쓴 것인지 가리기 어렵습니다. 부가가치세법 제40조와 시행령 제81조 제1항에 따라 면세사업등에 관련된 매입세액은 공통매입세액에 면세공급가액을 총공급가액으로 나눈 비율을 곱해 계산하고 그만큼은 공제하지 못합니다. 예를 들어 공통 임차료 부가세가 100만원이고 불공제 비율이 99%로 계산되면 공제받는 몫은 1만원 안팎입니다. 비율은 가정입니다.
매매 금액을 어떻게 넣는가가 쟁점입니다
상품권 판매액이 수천만원이고 대행 수수료가 수십만원이면, 매매 쪽 판매금액을 그대로 넣을 때 비율이 거의 100%에 가까워집니다. 실제로 같은 업종 사업자가 이런 불균형을 이유로 매매 이익 기준으로 계산할 수 있는지 질의한 사례가 있습니다(서면-2017-부가-1727). 국세청 회신은 기존 해석을 안내하는 데 그쳤고 어느 금액을 넣어야 하는지는 이 글에서 단정하지 않겠습니다. 신고 방식에 따라 세액 차이가 크므로 상담으로 기준을 먼저 잡는 편이 좋습니다. 대행 수수료의 과세 구조는 판매대행 수수료 부가세에서 먼저 확인하세요.
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자주 묻는 질문
공통 매입세액이 5만원 미만이면 그냥 다 공제하나요?
시행령 제81조 제2항 제2호에 따라 해당 과세기간 공통매입세액이 5만원 미만이면 공제되는 매입세액으로 봅니다. 그 과세기간에 모인 공통매입세액 합계가 기준이라는 점을 확인하세요.
매매만 하다가 대행을 시작했어요. 안분을 처음부터 해야 하나요?
과세사업과 면세사업등의 공급가액이 모두 생기는 과세기간부터 비율 계산이 가능해집니다. 어느 한쪽 공급가액이 없는 과세기간은 시행령 제81조 제4항의 순서(매입가액 비율 등)를 따르므로 그 해에는 따로 확인하세요.
매입세액을 불공제하면 비용으로는 쓰나요?
공제받지 못한 부가세는 소득세나 법인세 계산에서 비용에 들어가는지 별도로 검토합니다. 이 글은 부가세 공제 여부만 다룹니다.
세무법인 서진(서울 여의도). 세무법인 하나(기장/신고), 회계법인 베율(회계 감사/검토), 법률사무소 백화(조세불복/쟁송)를 거쳤습니다. 처음 상담부터 신고까지 직접 확인합니다.
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