배달앱, 프랜차이즈 본부 세무조사 소식, 입점 사장님 장부에서는 무엇을 볼까요?

세금으로 보면

입점 사장님이 먼저 볼 것은 배달앱에 내는 돈입니다. 중개수수료와 광고비는 사업을 위해 산 용역이라 거기 붙은 부가세는 매입세액으로 공제됩니다(부가가치세법 제38조). 세금계산서를 받지 않았거나 필요한 기재사항이 빠진 세금계산서라면 공제되지 않습니다(제39조 제1항 제2호). 홈택스에 올라온 배달앱 세금계산서가 정산서 금액과 맞는지 맞춰 보세요.

할인쿠폰은 누가 부담했는지부터 봅니다. 사장님이 통상 가격에서 직접 깎아 준 금액은 공급가액에 넣지 않습니다(제29조 제5항 제1호). 반대로 손님에게 따로 주는 장려금 성격의 돈은 과세표준에서 빼지 않습니다(제29조 제6항). 배달앱이 부담한 쿠폰을 앱이 사장님께 채워 주는 구조라면 처리가 달라질 수 있으니 정산서에서 부담 주체를 확인해야 합니다.

본부에서 사는 필수품목은 비용의 큰 몫입니다. 과세 품목은 세금계산서를 받아야 매입세액이 공제됩니다. 면세 농산물이나 수산물은 계산서를 받아 두면 음식점은 의제매입세액공제를 받을 수 있습니다(제42조). 개인 음식점의 공제율은 108분의 8이고 과세표준 2억원 이하면 2026년 12월 31일까지 109분의 9입니다.

종합소득세에서는 원재료 매입가와 판매 관련 부대비용이 필요경비가 됩니다(소득세법 시행령 제55조 제1항 제1호, 제1호의2). 공급가가 올랐다면 그만큼 비용도 늘어나니, 본부 거래명세서와 세금계산서 금액이 같은지 확인해 두세요.

근거 조문

• 부가가치세법 제38조 사업을 위해 산 재화와 용역의 부가세는 매입세액 공제
• 부가가치세법 제39조 세금계산서를 받지 않았거나 필요적 기재사항이 빠지면 매입세액 불공제
• 부가가치세법 제29조 통상의 대가에서 직접 깎아 준 금액은 공급가액 제외, 공급받는 자에게 주는 장려금은 과세표준에서 빼지 않음
• 부가가치세법 제42조 면세 농산물 의제매입세액, 개인 음식점 108분의 8(과세표준 2억원 이하 2026년 말까지 109분의 9)
• 소득세법 시행령 제55조 원재료 매입가와 판매 관련 부대비용은 필요경비

조문은 법제처 국가법령정보센터 현행본 기준(2026.11.06 확인)입니다.