이슈 속 세금 / 근로소득 / 2026.11.11
건강검진비 과세 논란, 회사가 내 준 종합검진에도 세금이 붙나요? 삼성 계열사 6억 6천만원 추징과 12월 조세심판원 결정
결론부터 회사가 직원 건강검진비를 대신 내 주면 국세청은 그 금액을 직원의 근로소득으로 봅니다. 2024년 국세청 회신도 회사가 지원한 건강검진비는 근로소득 수입금액에 들어간다고 답했습니다. 건강보험공단의 일반건강검진은 회사가 검진비를 내지 않아 과세할 금액이 없습니다. 지금 다투는 것은 회사가 따로 제공한 종합검진이고 조세심판원 결정은 12월에 나올 전망입니다.

무슨 일이었나
국세청은 삼성그룹 금융계열사 한 곳을 세무조사하면서 회사가 임직원에게 제공한 1인당 약 60만원 상당의 종합검진비를 근로소득으로 판단했습니다. 2022~2025년분 근로소득세 약 6억 6천만원을 추징했고 회사는 과세전적부심사가 기각되자 조세심판원에 심판을 청구했습니다. 결정은 12월에 나올 것으로 전망됩니다(위키트리 2026.11.10).
보도에 따르면 국세청은 산업안전보건법상 사업주의 건강진단 의무를 건강보험공단의 국가건강검진으로 채울 수 있다고 봤습니다. 그래서 회사가 따로 제공한 검진비 전액을 근로소득으로 봤고 추가 CT 검사가 들어 있던 점, 채용공고에 복리후생으로 안내한 점도 근거로 들었습니다(더퍼블릭 2026.11.9).
회사는 검진비를 직원에게 현금으로 주지 않고 의료기관에 직접 냈으며 사업상 필요에 따른 비용이라고 맞서고 있습니다. 국회에서는 법정 검진과 복지 목적 검진을 구분해 과세 기준을 분명히 해 달라는 요구가 나왔습니다(복지TV부울경방송 2026.11.9).
기사 원문
- 위키트리, 직장인 월급 지켜주겠다더니 건강검진에까지 세금 부과하겠다는 정부 (2026.11.10)
- 더퍼블릭, 삼성 건강검진비 과세 결판 12월로, 국세청 vs 삼성 핵심 쟁점은? (2026.11.9)
- 복지TV부울경방송, 직장인 건강검진비까지 과세하나 (2026.11.9)
기사에 나온 사실만 옮겼습니다. 특정 개인이나 회사의 세금 문제를 단정하는 글이 아닙니다.
세금으로 보면
근로소득은 근로를 제공하고 받는 봉급, 급료, 임금, 상여, 수당과 이와 비슷한 성질의 급여입니다(소득세법 제20조 제1항 제1호). 대법원은 근로소득에 지급형태나 명칭과 상관없이 근로의 대가인 모든 경제적 이익이 들어가고 근로를 전제로 근로조건의 내용을 이루는 급여도 포함된다고 봅니다(대법원 2025.9.11. 선고 2023두59391 판결, 복지포인트 사건).
세금을 매기지 않는 근로소득은 법에 적힌 것만 됩니다(소득세법 제12조 제3호). 복리후생 성격으로는 사택 제공 이익, 직장어린이집 비용, 연 70만원 이하 단체보장성보험료 등이 있습니다(같은 법 시행령 제17조의4). 건강검진비는 이 목록에 없습니다.
국세청은 2024년 3월 회사가 근로자와 가족의 검진비를 의료기관에 일괄 지급한 사례에 답했습니다. 회사가 지원한 건강검진비는 그 근로자의 근로소득 수입금액에 들어가고 의료비 공제 대상에도 들어간다는 내용입니다. 과세된 검진비는 연말정산에서 의료비 세액공제에 넣을 수 있다는 뜻입니다(서면-2024-원천-0199).
사업주는 상시 근로자에게 일반건강진단을 해야 합니다(산업안전보건법 제129조 제1항). 사무직은 2년에 1회 이상, 그 밖의 근로자는 1년에 1회 이상입니다(같은 법 시행규칙 제197조 제1항). 국민건강보험법에 따른 건강검진을 받으면 일반건강진단을 한 것으로 봅니다(시행규칙 제196조 제1호). 공단 검진은 회사가 검진비를 내지 않으니 직원에게 더해질 소득이 없습니다.
법정 검진과 회사 종합검진, 세금에서 다른 점
| 구분 | 누가 비용을 내나 | 직원 세금 |
|---|---|---|
| 건강보험공단 일반건강검진 | 공단 | 과세할 금액 없음 |
| 회사가 따로 제공한 종합검진 | 회사 | 국세청은 근로소득으로 봄(2024년 회신) |
| 직원 가족 검진비 지원 | 회사 | 근로소득, 의료비 공제 대상(2024년 회신) |
삼성 계열사 사건은 조세심판원에서 다투는 중입니다.
검진비 60만원이 급여에 더해지면 세금은 그 사람의 세율 구간에 따라 달라집니다. 지방소득세까지 넣어 6% 구간이면 3만 9,600원, 15% 구간이면 9만 9천원, 24% 구간이면 15만 8,400원, 35% 구간이면 23만 1천원입니다. 4대 보험료는 따로 계산합니다.
검진비 60만원이 급여에 더해질 때 늘어나는 세금
60만원 × 세율 × 1.1(지방소득세)로 계산했습니다. 의료비 세액공제와 4대 보험료는 넣지 않았습니다.검진비가 급여로 과세됐다면 연말정산에서 의료비 세액공제에 넣을 수 있습니다(국세청 서면-2024-원천-0199).
근거 조문
- 소득세법 제20조 근로소득은 근로 제공으로 받는 봉급, 임금, 상여, 수당과 이와 유사한 성질의 급여
- 소득세법 제12조 비과세 근로소득은 제3호 각 목에 열거된 것만 해당
- 소득세법 시행령 제17조의4 비과세 복리후생적 급여(사택, 직장어린이집, 단체보장성보험료 연 70만원 등)
- 산업안전보건법 제129조 사업주의 일반건강진단 실시 의무
- 산업안전보건법 시행규칙 제196조 국민건강보험법에 따른 건강검진을 받으면 일반건강진단을 실시한 것으로 인정
- 산업안전보건법 시행규칙 제197조 사무직 2년에 1회 이상, 그 밖의 근로자 1년에 1회 이상
조문은 법제처 국가법령정보센터 현행본 기준(2026.11.11 확인)입니다.
내 경우 조심할 점
- 조세심판원 결정은 아직 나오지 않았습니다. 결정이 나와도 그 사건에 대한 판단이어서 다른 회사에 그대로 적용되는지는 정부의 해석과 제도 정비를 봐야 합니다.
- 회사는 종합검진 지원 규정과 대상, 1인당 금액, 가족 포함 여부를 정리해 두세요. 가족 검진비 지원도 2024년 회신에서는 근로소득으로 봤습니다.
- 검진비를 이미 급여로 처리해 원천징수하는 회사라면 직원에게 의료비 세액공제를 안내해 주세요.
- 직원은 급여에 포함돼 과세된 검진비만 의료비 공제에 넣는 것이 안전합니다. 원천징수영수증에서 포함 여부를 확인하세요.
- 과세가 굳어지면 회사는 빠뜨린 원천징수 세금과 가산세, 4대 보험료 회사 부담분을 함께 계산해야 할 수 있습니다.
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